Патент на изобретение №2397707

Published by on




РОССИЙСКАЯ ФЕДЕРАЦИЯ



ФЕДЕРАЛЬНАЯ СЛУЖБА
ПО ИНТЕЛЛЕКТУАЛЬНОЙ СОБСТВЕННОСТИ,
ПАТЕНТАМ И ТОВАРНЫМ ЗНАКАМ
(19) RU (11) 2397707 (13) C1
(51) МПК

A61B10/00 (2006.01)
C12Q1/68 (2006.01)

(12) ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ К ПАТЕНТУ

Статус: по данным на 28.09.2010 – действует

(21), (22) Заявка: 2008148110/14, 05.12.2008

(24) Дата начала отсчета срока действия патента:

05.12.2008

(46) Опубликовано: 27.08.2010

(56) Список документов, цитированных в отчете о
поиске:
ПОЧТАРЕНКО В.А. и др. Генетический статус человека как фактор развития воспалительных заболеваний пародонта.: газета «Стоматология сегодня», 2006, 1 (51). RU 2188576 C1, 10.09.2002. RU 2329509 C2, 20.07.2008. НИКОЛАЕВА Е.Н. и др. Особенности полиморфизма генов HLA II класса у пациентов с воспалительными заболеваниями пародонта.Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А.Овчинникова, 2006, т.2, 2, с.21-29. STEIN J. et al. Are there HLA combinations typical supporting for or making resistant against aggressive and/or chronic periodontitis?, J. Periodont. Res., 2003, vol.38, p.508-517.

Адрес для переписки:

644043, г.Омск, ул. Ленина, 12, ОмГМА, патентный отдел

(72) Автор(ы):

Горбунова Ирина Леонидовна (RU),
Кононов Алексей Владимирович (RU),
Поморгайло Елена Геннадьевна (RU),
Ромащенко Аида Герасимовна (RU),
Недосеко Владимир Борисович (RU),
Вишнягова Наталья Александровна (RU)

(73) Патентообладатель(и):

Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования “Омская государственная медицинская академия Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию” Росздрава (RU)

(54) СПОСОБ ОЦЕНКИ ИНТЕНСИВНОСТИ РЕАКЦИИ ВОСПАЛЕНИЯ У БОЛЬНЫХ ХРОНИЧЕСКИМ ПАРОДОНТИТОМ

(57) Реферат:

Изобретение относится к медицине, а именно к стоматологии и общей патологии, и может найти свое применение при оценке интенсивности воспаления в тканях пародонта у больных пародонтитом, на основании установлении ассоциаций между полиморфизмами генов, регулирующих реакцию воспаления CD14(C/C, С/Т, Т/Т) при С(-260)Т, TNF-a (A/A, G/A, G/G) при G(-308)A и c-fms (3’UTR ТССА) и (del425) и показателями тканевой резистентности пародонта. Проводят оценку уровня экспрессии молекулы CD-14 (С/С, С/Т, Т/Т) при С(-260)Т в сопоставлении со значениями папиллярно-маргинально-альвеолярного индекса и индекса кровоточивости, оценку уровня экспрессии цитокина TNF- (A/A, G/A, G/G) при G(-308)A – с увеличением значений пародонтального индекса и костного показателя, характеризующего степень резорбции костной ткани, и оценку уровня экспрессии c-fms (3’UTR TCCA) и (del425) – с глубиной пародонтальных карманов и повышением индекса кровоточивости среди гетерозигот (С/Т) и гомозигот (С/С). Способ обеспечивает оценку интенсивности воспаления у больных хроническим пародонтитом путем установления ассоциаций между показателями тканевой резистентности полости рта и генетическими маркерами воспаления. 3 табл.

Изобретение относится к медицине, а именно к стоматологии и общей патологии, и может найти свое применение при разработке новых подходов к прогнозированию воспалительного ответа в тканях пародонта, основанных на оценке реакции тканевых структур полости рта.

8. – P.641-645].

3. – P.279-292]. В связи с этим, при прогнозе течения хронического воспаления в пародонте именно с клинических позиций должны быть интерпретированы результаты молекулярных механизмов тканевой резистентности полости рта.

Задача изобретения – разработка способа оценки интенсивности воспаления у больных хроническим пародонтитом путем установления ассоциаций между показателями тканевой резистентности полости рта и генетическими маркерами воспаления.

Результат решения поставленной задачи – улучшение качества оказания специализированной стоматологической помощи больным пародонтитом на основании оценки интенсивности воспаления.

Поставленная задача решается за счет того, что в комплексе клинико-лабораторных параметров определяется информативность полиморфизмов генов CD-14, TNF- и c-fms, а также их генотипов, выбранных в качестве генетических маркеров воспаления в пародонте, которые могут быть использованы в качестве теста критического состояния возможной реализации болезни у конкретного пациента.

Определение набора генов-кандидатов обусловлено их участием в реакции воспаления. CD 14 является главным рецепторным белком, реагирующим с липополисахаридами клеточной стенки грамм-отрицательных бактерий, опознает структуру липополисахарида и активизирует врожденные защитные механизмы клетки. TNF- -противовспалительный цитокин, который продуцируется активированными макрофагами при воспалительном ответе и регулирует иммунные реакции как в зоне воспаления, так и на системном уровне. Макрофагколониестимулирующий фактор c-fms определяет дифференцировку, пролиферацию и выживаемость клеток моноцит/макрофагального ряда и, таким образом, вовлечен в формирование неспецифического иммунитета. При хроническом генерализованном пародонтите фактор роста макрофагальных клеток c-fms участвует в дифференцировке остеокластов.

Анализ отличительных признаков показал, что предлагаемый способ существенно отличается от известных тем, что предполагает оценку интенсивности воспаления в тканях пародонта на основании сопоставления уровня экспрессии генов, регулирующих воспалительную реакцию, с атрофией костной ткани челюстей, степенью расшатанности зубов, кровоточивостью десны и глубиной пародонтальных карманов. Доказана возможность использования генов-кандидатов воспаления в качестве маркеров, определяющих тяжесть течения воспаления в тканях пародонта.

Сущность изобретения.

Исследованы однонуклеотидные полиморфизмы генов, регулирующих реакцию воспаления CD14(C/C, С/Т, Т/Т) при С(-260)Т, TNF- (А/A, G/A, G/G) при G(-308)A и c-fms (3 UTR ТССА) и (del425). Образцы ДНК, выделены из венозной крови обследуемых. Генотипирование осуществлялось с использованием современных молекулярных методов изучения генома: секвинирования ДНК, аллель-специфической ПЦР, ПДРФ и методов автоматического генотипирования. Известные полиморфизмы этих генов были оценены с точки зрения их генетической информативности и перспективности для последующего ассоциативного анализа.

Выборки больных хроническим пародонтитом и контрольная популяционная (лица, не имеющие патологии пародонта) были сформированы из представителей европеоидной расы, проживающей на территории г.Омска. Исследовательскую когорту составили лица обоего пола, в количестве 289 человек, из которых 148 мужчин и 141 женщина, в возрасте 17-75 лет. Средний возраст 36±4,8 лет. Группа сравнения включала лиц обоего пола, не имеющих патологии пародонта (95 человек: 48 мужчин и 47 женщин).

При анализе аллельного полиморфизма гена CD 14 среди больных хроническим генерализованным пародонтитом было зафиксировано статистически значимое (р<0,001) повышение частот генотипов С/С и С/Т в группе больных пародонтитом, по сравнению с группой пациентов, не имеющих клинически выраженных признаков воспаления в тканях пародонта (табл.1).

Таблица 1.
Распределение частот генотипов и аллелей полиморфизма гена CD14 С(-260)Т у больных пародонтитом и пациентами без признаков воспаления в тканях пародонта
Группа Число обследован-
ных
Частота генотипа, (абс. число) Частота аллеля, (абс. число)
С/С С/Т Т/Т С Т
Пациенты без клинически выраженных признаков воспаления в тканях пародонта 95 44 51 29 315 139
Пародонтит 194 99 р<0,001 115 р<0,001 38 345 169
Примечание: р-значимость рассчитана по отношению к частотам соответствующих генотипов в группе пациентов без клинически выраженных признаков пародонтита

В группе пациентов, гомозиготных по мутантному Т-аллелю, отмечаются значимое увеличение следующих показателей, характеризующих состояние локальной резистентности, по отношению к пациентам группы сравнения, имеющих такой же генотип: индекс гигиены полости рта по методике Green J., Vermillion J., 1964 (OHI-S); индекс зубного налета (ИЗН); индекс зубного камня (ИЗК); индекс кровоточивости по методике Mühlemann H.R, Son S., 1971 (SBI); папиллярно-маргинально-альвеолярный индекс по Schour Е. и Massler J. в модификации Parma С, 1976 (РМА). Эти показатели отражают процессы, которые либо инициируют воспаление в пародонте (OHI-S; ИЗН; ИЗК), либо поддерживают воспаление (OHI-S), либо являются его следствием (SBI; РМА).

Результаты изучения частот генотипов С/С; С/Т полиморфизма гена CD 14 у больных хроническим генерализованным пародонтитом обосновывают высокую диагностическую информативность экспрессии молекулы CD-14 (С/С, С/Т, Т/Т) при С(-260)Т при оценке интенсивности воспаления в пародонте. Ассоциации степеней тяжести пародонтита с генотипом С/С полиморфизма гена CD14, значительно выше, чем для всех групп исследованных ранее в этом отношении генетических локусов.

При генотипировании пациентов по TNF- гену в позиции -308 были обнаружены все возможные вариации аллелей (А/А; G/A; G/G) обследованных пациентов. У больных пародонтитом отмечается статистически значимое (р=0,001) увеличение частоты генотипа G/G (гомозигота по мутантному аллелю). При этом отсутствие этого полиморфизма в группе сравнения предопределяет резистентность тканей пародонта и не способствует развитию воспаления при воздействии равных экзо- и эндогенных факторов (табл.2). Вместе с тем, отмечается значимое (р=0,003) снижение частоты генотипа А/А полиморфизма гена TNF- у пациентов группы сравнения по отношению к частоте соответствующего генотипа в популяции.

В результате проведенного исследования была показано значительная связь частоты генотипа А/А полиморфизма гена TNF- у пациентов, имеющих пародонтит с некоторыми показателями тканевой резистентности полости рта. Так отмечалась статистически значимая корреляционная связь между частотой изучаемого полиморфизма и индексом РМА; индексом кровоточивости по Mühlemann H.R, Son S.. и индексом зубного камня.

Получены статистически значимые данные о наличии ассоциаций между продукцией цитокина TNF- (А/А, G/A, G/G) при G(-308)А и степенью тяжести хронического генерализованного пародонтита. Было показано, что частоты изученных аллелей промоторного участка гена различаются в зависимости от значений индекса PI по Russel, отмечается статистически значимое (р=0,001) влияние данных полиморфизмов на степень тяжести пародонтита.

Таблица 2.
Распределение частот генотипов и аллелей полиморфизма гена TNF- G(-308)А у больных пародонтитом и пациентами без признаков воспаления в тканях пародонта
Группа Число обследованных Частота генотипа, (абс. число) Частота аллеля, % (абс.число)
А/А G/G G/A G А
Пациенты без клинически выраженных признаков воспаления в тканях пародонта 95 38 p1=0,003 12 265 224
Пародонтит 194 131 286 р=0,001 44 286 214
Примечание: р-значимость рассчитана по отношению к частоте генотипа G/G в группе сравнения;
p1-значимость рассчитана по отношению к частоте генотипа А/А в группе больных без клинически выраженных признаков воспаления тканей пародонта по отношению к популяционному контролю.

При определении полиморфизма гена c-fms (3UTR) отмечается его клиническая информативность с точки зрения установления ассоциаций со степенью тяжести воспалительного процесса в пародонте. Установлено, что динамика изменений глубины пародонтальных карманов во всех обследованных группах больных пародонтитом определяется генотипом пациента. Увеличение глубины пародонтальных карманов при изначальной их глубине 3мм среди гетерозигот (С/Т) и гомозигот (С/С) произошло в 36,8±18,9% и 21,5±17,1% случаев соответственно (табл.3).

Таблица 3.
Уровень полиморфизма (del 425 и 3UTR) гена c-ms у больных хроническим генерализованным пародонтитом различной степени тяжести
Ген Категории больных ХГП Кол-во q%(Sq) Частота генотипа рр(Npp) Частота генотипа pq(Npq) Частота генотипа qq(Nqq) 2х-в, (Р)
c-fms (3UTR) Пародонтит легкой степени (ПК до 3 мм) 48 19,08 (3,2) 0,711 (19) 0,197 (10) 0,092 (4) 9,8 (р=0,007)
Пародонтит средней степени (ПК до 4-6 мм)* 45 25,20 (2,8) 0,596 (20) 0,358 (14) 0,102 (11) соотв. Х-В
Пародонтит тяжелой степени (ПК7 мм)* 54 37,26 (3,4) 0,363 (17) 0,529 (27) 0,108 (10) соотв. X-B
Примечание: *2 – критерий, p=0,009; Фишера-критерий: F2.Sjded, 450=0,007(статистически значимое отличие по частотам аллелей и генотипов между пациентами со средней и тяжелой степенями тяжести пародонтита;
**Фишера-критерий: F2-Sjded, 450=0,03 (статистически значимое отличие между пациентами со средней и тяжелой степенями тяжести пародонтита.

Формула изобретения

Способ оценки интенсивности реакции воспаления у больных хроническим пародонтитом, основанный на определении уровня экспрессии генов, участвующих в реакции воспаления, отличающийся тем, что оценку уровня экспрессии молекулы CD-14 (С/С, С/Т, Т/Т) при С(-260)Т проводят в сопоставлении со значениями папиллярно-маргинально-альвеолярного индекса и индекса кровоточивости, оценку уровня экспрессии цитокина TNF- (A/A, G/A, G/G) при G(-308)A – с увеличением значений пародонтального индекса и костного показателя, характеризующего степень резорбции костной ткани, и оценку уровня экспрессии c-fms (3’UTR ТССА) и (del425) – с глубиной пародонтальных карманов и повышением индекса кровоточивости среди гетерозигот (С/Т) и гомозигот (С/С).

Categories: BD_2397000-2397999