Патент на изобретение №2393772

(54) СПОСОБ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ РАЗВИТИЯ РЕЦИДИВНОГО ИНВАЗИВНОГО РАКА МОЧЕВОГО ПУЗЫРЯ

(57) Реферат:

Изобретение относится к медицине, а именно к онкоурологии. Из лимфоцитов периферической венозной крови выделяют ДНК, проводят ПЦР-анализ с последующей рестрикцией амплифицированных фрагментов полиморфного локуса Ile105Val гена GSTPI. При обнаружении у больных с поверхностными формами РМП гомозиготного генотипа Val/Val прогнозируют высокий риск развития рецидивного инвазивного рака мочевого пузыря (РМП). При обнаружении гомозиготного генотипа I1е/I1е прогнозируют минимальный риск развития рецидивного инвазивного РМП. Использование изобретения прогнозирует риск развития инвазивного РМП у пациентов с поверхностными формами РМП. Способ обеспечивает высокую точность прогноза.

Предлагаемое изобретение относится к медицине, а именно к онкоурологии, и может быть использовано для выявления групп риска к развитию инвазивного рака мочевого пузыря у больных с поверхностными формами рака мочевого пузыря.

Рак мочевого пузыря (РМП) – одна из актуальных проблем в урологии и онкологии.

1. – С.8-12].

Выбор метода лечения РМП зависит от степени инвазии опухоли. Различают поверхностные (неинвазивные) (T_is-T_aT₁) и инвазивные (Т₂-Т₃-Т₄) формы РМП. Тактика лечения и прогноз поверхностных и инвазивных форм РМП значительно отличаются. Прогрессия поверхностного рака в инвазивный наблюдается в 25-65% случаев. Несоответствие между уровнем прогрессии поверхностного рака мочевого пузыря в инвазивный у различных пациентов позволило предположить генетическую детерминированность в развитии инвазии.

7. – P.409-15]. Транзиция аденина на гуанин в 313 положении 5 экзона гена (A313G) приводит к аминокислотной замене в 105 положении полипептида (Ile105Val), которая затрагивает последовательность ДНК, кодирующую сайт связывания фермента с определенными субстратами, и таким образом ведет к изменению активности фермента. По мнению ряда авторов, фермент, содержащий валин в 105 положении, в 7 раз активнее по отношению к диолам эпоксидов ПАУ, однако обладает в 3 раза более низкой способностью превращать 1-хлоро-2,4-динитробензен, чем фермент без замены.

Авторами в научно-медицинской и патентной литературе не обнаружено сведений об известности способа прогнозирования развития инвазивного рака мочевого пузыря у пациентов с поверхностными формами рака мочевого пузыря.

Прогнозирование риска развития инвазивного рака мочевого пузыря у пациентов с поверхностными формами рака мочевого пузыря имеет значение для определения частоты и характера наблюдения, проведения адъювантного лечения, а также влияет на выбор методики оперативного вмешательства.

Задачей изобретения является разработка объективного, высокоинформативного способа прогнозирования развития инвазивного рака мочевого пузыря у пациентов с поверхностными формами рака мочевого пузыря на основе выявления молекулярно-генетических маркеров. Метод доступен по реактивам и оборудованию.

Технический результат – получение критериев прогноза развития инвазивного рака мочевого пузыря у пациентов с поверхностными формами рака мочевого пузыря.

Предлагаемый способ осуществляется следующим образом.

₂, 10 мМ трис-HCl pH 7,6. Ядра осаждают двойным центрифугированием при 4°С и 4000 g (сначала в течение 20 минут, а затем в течение 10 минут после слива супернатанта и повторного добавления 10 мл лизирующего буфера). Полученный осадок ресуспендируют в 400 мкл буфера Soline EDTA (25 мМ EDTA, NaCl 5M pH 8,0), добавляют 40 мкл 10% SDS и 30-40 мкл протеиназы К («Promega») до конечной концентрации 10 мг/мл. После перемешивания на шейкере инкубируют при 37°С в течение 10-12 часов.

Очистку ДНК от белков производят с помощью эктракции лизата забуференным фенолом (200 мкл меркаптоэтанола на 50 мл фенола-Трис-HCl, pH 7,8), смесью фенол-хлороформа (1:1) и хлороформом (2 мл изоамилового спирта на 48 мл хлороформа). При этом фенол активно денатурирует белки, смесь фенол-хлороформа полностью ингибирует РНК активность, в результате последней экстракции хлороформом из препарата ДНК удаляют остатки фенола. Экстракцию производят, смешивая лизат и растворитель до образования эмульсии. Разделение фаз проводят центрифугированием при 10000-12000 g в течение 8-10 мин. Осаждение ДНК производят добавлением двух объемов охлажденного 96% этанола. Осажденную ДНК дважды промывают 70% этанолом для очистки от солей, затем удаляют этанол из пробирки и подсушенный при комнатной температуре осадок ДНК растворяют в деионизированной воде. Раствор ДНК хранят при -20°С.

Анализ полиморфных локусов гена GSTP1 (Ile105Val) проводят методом полимеразной цепной реакции синтеза ДНК (ПЦР) на термоциклере в автоматическом режиме с использованием локусспецифических олигонуклеотидных праймеров. Реакционная ПЦР-смесь содержит следующие обязательные компоненты: 1,25 мкл 1×ПЦР-буфера (60 мМ Tris-HCl pH 8.5), 1,5 mM MgCl₂, 25 mM KCl, 10 mM 2-меркаптоэтанол, 0.1% тритон Х-100), 200 мМ каждого dNTP, no 1 мкл соответствующих праймеров, примерно 100 нг геномной ДНК, 1 ед Taq-полимеразы («Сибэнзим», Россия) и необходимое количество деионизированной воды до объема 12.5 мкл.

Режим амплификации включает: предварительную денатурацию (94°С, 5-7 мин), 28-32 цикла амплификации: денатурация – 94°С, 40 сек; отжиг – 54 t°C, 40 сек; синтез – 72°С, 1 мин; завершающий синтез (72°С, 7-10 мин).

Полиморфизм локусов гена GSTP1 исследуют методом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ).

После амплификации ПЦР-продукт подвергают гидролизу соответствующей эндонуклеазой рестрикции. Для этого 5 мкл амплификата смешивают с 5 ед. фермента в соответствующем буфере, смесь инкубируют при определенной температуре, согласно инструкциям производителей («Сибэнзим») на протяжении 12 часов.

Результаты амплификации и рестрикции оценивают при помощи вертикального электрофореза в 6-8%-ном полиакриламидном геле (исходное соотношение акриламида и метиленбисакриламида 29:1) при напряжении 200-300 В (10 В/см). По окончании электрофореза гель окрашивают раствором бромистого этидия (0,1 мкг/мл) в течение 15 минут и фотографируют в проходящем ультрафиолетовом свете. Для идентификации аллелей использовали маркер молекулярного веса 100 bp DNA ladder («Сибэнзим»). При обнаружении у больных с поверхностными формами РМП гомозиготного генотипа Val/Val прогнозируют высокий риск развития рецидивного инвазивного РМП. При обнаружении гомозиготного генотипа Ile/Ile прогнозируют минимальный риск развития рецидивного инвазивного РМП.

Проведен анализ на выборке из 145 больных с диагнозом РМП, из них 68 пациентов с инвазивным и 77 с поверхностным РМП, находившихся на стационарном лечении в Республиканском онкологическом диспансере и Республиканской клинической больнице г.Уфы (РБ) в период с 2005 по 2008 г. Клиническое обследование больных проводилось врачами стационаров и включало обязательные и дополнительные методы исследования. Средний возраст больных с инвазивным РМП составил 62.07±11.12 лет, а с поверхностным РМП – 60.48±11.50 лет.

Ассоциацию генотипов, аллелей с развитием заболевания выявляли, сравнивая выборки больных и здоровых индивидов по частоте одного признака с использованием критерия ². Статистически значимыми считали различия при p<0.05.

Относительный риск заболевания по конкретному признаку вычисляли как соотношение шансов (OR – odds ratio): OR=(a×d)/(b×c),

где a – частота аллеля (генотипа) в выборке больных инвазивными формами РМП, b – частота аллеля (генотипа) в выборке больных поверхностными формами РМП, с – сумма частот остальных аллелей (генотипов) в выборке больных инвазивными формами РМП, d – сумма частот остальных аллелей (генотипов) в выборке больных поверхностными формами РМП. Доверительный интервал для относительного риска рассчитывали по следующей формуле:

Значение OR>1.5 рассматривали как положительную ассоциацию заболевания с признаком («фактор риска»), OR<0.5 – как отрицательную ассоциацию («фактор устойчивости»).

Анализ распределения генотипов локуса Ile105Val гена GSTP1 у больных РМП в зависимости от степени инвазии показал, что генотип Val/Val выявлялся достоверно чаще у индивидов с инвазивным течением заболевания, чем у индивидов с неинвазивной формой РМП (17% и 3% соответственно, ²=5.9; р=0.01). В группе больных с неинвазивным характером роста частота генотипа Ile/Ile гена GSTP1 увеличена до 67% против 39% в группе больных с инвазивными формами РМП (²=10.1; р=0.002). Показатель отношения шансов для данного генотипа составил 0.3 (95% CI 0.1-0.6), указывая на его протективную значимость в отношении развития инвазивных форм РМП.

Предлагаемый способ иллюстрируется следующими клиническими примерами.

Пример 1. Пациент, 42 года, поступил в урологическое отделение РКБ с жалобами на примесь крови в моче в течение 2 недель.

Объективно: состояние удовлетворительное; кожа и видимые слизистые обычной окраски. Дыхание везикулярное, тоны сердца ясные ритмичные. Живот мягкий безболезненный. Мочеиспускание самостоятельное, безболезненное. В моче примесь крови. Анализ крови: эр – 3,4×10¹²/л, л – 10,5×10⁹/л, СОЭ – 19 мм/час. УЗИ органов брюшной полости без патологии. УЗИ мочевого пузыря выявило по задней стенке мочевого пузыря гиперэхогенное объемное образование 35×46 мм. ТРУЗИ подтвердило наличие объемного гиперэхогенного образования по задней стенке на 7 часах без инвазии в мышечную стенку размерами 35×45 мм, с кровотоком в режиме доплеровского картирования. Цистосткопия с биопсией подтвердила диагноз: умеренно-дифференцированный плоскоклеточный рак мочевого пузыря. Проведено исследование по предложенной методике. Установлено: пациент обладает генотипом Ile/Ile полиморфного локуса Ile105Val гена GSTP1. Риск развития рецидивного инвазивного рака мочевого пузыря у данного пациента минимален.

Произведена трансуретральная резекция опухоли мочевого пузыря с интраоперационной химиопрофилактикой митомицином. Пациенту рекомендовано контрольное УЗИ исследование 1 раз в 3 месяца в первый год наблюдения. При контрольном обследовании через 2 года у пациента не выявлен рецидив опухоли мочевого пузыря.

Пример 2. Пациент, 45 лет, поступил в урологическое отделение РКБ с жалобами на примесь крови в моче в течение месяца.

Объективно: состояние удовлетворительное; кожа и видимые слизистые обычной окраски. Дыхание везикулярное, тоны сердца ясные ритмичные. Живот мягкий безболезненный. Мочеиспускание самостоятельное, безболезненное. В моче примесь крови. Анализ крови: эр – 3,7×10¹²/л, л – 8,5×10⁹/л, СОЭ – 15 мм/час. УЗИ органов брюшной полости без патологии. УЗИ мочевого пузыря выявило по передней стенке мочевого пузыря гиперэхогенное объемное образование 40×35 мм. ТРУЗИ подтвердило наличие объемного гиперэхогенного образования по задней стенке на 8 часах без инвазии в мышечную стенку размерами 42×37 мм, с кровотоком в режиме доплеровского картирования. Цистосткопия с биопсией подтвердила диагноз: умеренно-дифференцированный плоскоклеточный рак мочевого пузыря. Проведено исследование по предложенной методике. Установлено: пациент обладает гомозиготным генотипом Val/Val полиморфного локуса Ile105Val гена GSTP1. У данного пациента высокий риск развития рецидива инвазивного рака мочевого пузыря.

Произведена трансуретральная резекция опухоли мочевого пузыря с интраоперационной химиопрофилактикой митомицином. В послеоперационном периоде пациенту проведена внутрипузырная иммунотерапия. Пациенту рекомендовано контрольное УЗИ и цистоскопическое исследование через 1 месяц и в дальнейшем 1 раз в 3 месяца. При 3-м контрольном УЗИ исследовании выявлен рецидив опухоли с инвазией в стенку мочевого пузыря. Пациенту произведена радикальная цистэктомия с илеоцистопластикой по Штудеру.

Таким образом, выявление высокого риска развития инвазии опухоли у данного пациента позволило выбрать более активную тактику послеоперационного наблюдении и лечения, что привело к своевременной диагностике развития инвазивного РМП и своевременному выполнению радикальной цистэктомии с илеоцистопластикой.

Формула изобретения

Способ прогнозирования риска развития рецидивного инвазивного рака мочевого пузыря (РМП) у пациентов с поверхностными формами РМП, характеризующийся тем, что из лимфоцитов периферической венозной крови выделяют ДНК, проводят анализ полиморфного локуса Ile105Val гена GSTP1 методом ПЦР с последующей рестрикцией амплифицированных фрагментов и при обнаружении генотипа Val/Val прогнозируют высокий риск развития инвазивного РМП, при обнаружении генотипа lle/lle прогнозируют минимальный риск.