Патент на изобретение №2385875
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(54) ПЕПТИД, ОБЛАДАЮЩИЙ РОСТОСТИМУЛИРУЮЩЕЙ АКТИВНОСТЬЮ ГРАНУЛОЦИТАРНОГО КОЛОНИЕСТИМУЛИРУЮЩЕГО ФАКТОРА ЧЕЛОВЕКА
(57) Реферат:
Изобретение относится к области биотехнологии, конкретно к получению биологически активных веществ пептидной природы, обладающих ростостимулирующей активностью гранулоцитарного колониестимулирующего фактора человека, и может быть использовано в медицине. Путем in silico конструирования получают олигопептид общей формулы I:
Настоящее изобретение относится к области биоорганической химии, биохимии и медицины, а именно к биологически активным веществам пептидной природы, обладающим ростостимулирующей активностью гранулоцитарного колониестимулирующего фактора человека, и могут найти применение в медицине, ветеринарии, а также в экспериментальной биохимии. Гранулоцитарный колониестимулирующий фактор (Г-КСФ) является основным гемопоэтическим фактором роста, который обеспечивает пролиферацию, дифференцировку и терминальное созревание миелоидных предшественников нейтрофильных гранулоцитов, а также стимулирует разнообразные функции зрелых нейтрофилов и увеличивает продолжительность их жизни. Г-КСФ играет важную роль в регуляции гранулоцитопоэза как в равновесном состоянии, так и в условиях его экстренной активации, например, при инфекции [1, 2]. Природный Г-КСФ человека является кислым гликопротеидом и содержит два дисульфидных мостика (Cys37-Cys43 и Cys65-Cys75) [3]. Он существует в двух формах: белок типа А состоит из 177 аминокислотных остатков, белок типа В, более активный и представляющий собой основную форму, – из 174 аминокислотных остатков. Молекулярная масса последнего составляет 19.6 кДа [4]. Рекомбинантный Г-КСФ человека из E.coli имеет ту же первичную структуру, что и природный Г-КСФ типа В, но не гликозилирован и содержит дополнительный остаток метионина на N-конце. Получение рекомбинантного Г-КСФ человека привело к созданию на его основе новых терапевтических средств, таких как Ленограстим®, Филграстрим®. В настоящее время рекомбинантный Г-КСФ человека широко применяется при целом ряде заболеваний, сопровождающихся миелосупрессией и инфекционными осложнениями, как, например, при химио- и радиотерапии рака, СПИДе, тяжелой хронической нейтропении, остром миелолейкозе, апластической анемии, миелодиспластическом синдроме, при трансплантации костного мозга и мобилизации клеток периферической крови для трансплантации, а также при повреждении кожи и мягких тканей с тяжелыми морфофункциональными и косметическими последствиями [5]. Результаты исследований, например [6, 7], показывают, что локальное применение рекомбинантного Г-КСФ, в частности, при поверхностной травме кожи, стимулирует процесс эпителизации, компенсаторные механизмы и обеспечивает скорейшее заживление раневого дефекта. Однако получение рекомбинантного Г-КСФ человека является весьма сложной и дорогостоящей технологией. Стоимость препаратов на основе рекомбинантного Г-КСФ человека достаточно высока, что ограничивает возможность его применения в терапевтических целях. Олигопептиды, способные заменить по своему действию Г-КСФ, на данный момент отсутствуют. Задачей настоящего изобретения является расширение арсенала эффективных и доступных терапевтических средств для лечения заболеваний, сопровождающихся миелосупрессией и инфекционными осложнениями. Основной технический результат, который может быть получен при осуществлении настоящего изобретения, заключается в реализации данного назначения: создании новых олигопептидов, обладающих ростостимулирующей активностью гранулоцитарного колониестимулирующего фактора роста и отличающихся высокой способностью к стимулированию дифференцировки эпителиальных клеток. В отличие от производства рекомбинантного Г-КСФ человека синтез заявляемых пептидов осуществляется по упрощенной и недорогостоящей технологии, так как включает небольшое количество стадий, что снижает стоимость препарата, сказывается на его доступности и, следовательно, расширяет возможности его применения. В этом состоит дополнительный технический результат изобретения. Основной технический результат достигается за счет создания пептидов (ряд пептидов, близких по виду активности, различающихся только величиной активности), общей формулы А-Х1-Х2-Х3-Х4-В, где А представляет собой Воc или Ас; Х1 представляет собой Glu, Asp, Leu, Pro или Ser; X2 представляет собой Asn, Gln, Ala или Gly; ХЗ представляет собой Gly, Asn, Val или p-Ala; X4 представляет собой Lys или отсутствует и В представляет собой ОМе, обладающих ростостимулирующей активностью гранулоцитарного колониестимулирующего фактора человека и проявляющих высокую стимулирующую активность в отношении дифференцировки стволовых клеток in vitro в направлении эпителиальных прогениторов. В формуле: Boc – трет-бутилоксикарбонил, Ас – ацетил, Glu – глутаминовая кислота, Asp – аспарагиновая кислота, Leu – лейцин, Pro – пролин, Ser – серии, Asn – аспарагин, Gln – глутамин, Ala – аланин, Gly – глицин, Val – валин, p-Ala – Для подтверждения ростостимулирующей активности заявляемых пептидов и их способности к стимулированию дифференцировки эпителиальных клеток проводили оценку их влияния на рост и дифференцировку линейных эмбриональных стволовых клеток in vitro (Пример 1). Активность оценивали методами морфометрического анализа при микроскопии культур клеток с использованием флюоресцентных меток в различные сроки культивирования. Пример 1 In vitro оценка влияния, например, одного из олигопептидов – Boc-Glu-Gln-Val-Lys-OMe на рост и дифференцировку линейных эмбриональных стволовых клеток (ЭСК) После удаления надосадочной жидкости культуру в лунках 24-луночного планшета покрывали 20 мкл рабочего раствора моноклональных антител, меченых с помощью FITS, и инкубировали в течение 30 минут в темноте при 4°С. Затем надосадочную жидкость удаляли и промывали с гепес-буфером дважды. Анализ культуры осуществлялся с помощью инвертированного флюоресцентного микроскопа с оптимумом регистрации 500 мс. В анализ брали 1000 событий. Регистрацию сигнала осуществляли с использованием фильтра 530/30 нм. Формирование множественных очагов эпителиоподобных клеток отмечалось уже к 8 дню эксперимента в сериях, где разведение пептида не превышало 1:100. К 10 дню происходила кластеризация эпителиоподобных клеток в скопления по 8-20 элементов (Таблица). Соседние эпителиоподобные клетки и их кластеры в ходе роста имели тенденцию к слиянию и образовывали в ряде случаев эпителиоподобные пласты и скопления толщиной до 3 уровней с количеством клеточных элементов не менее 1000. При этом о дифференцировке клеточных элементов в направлении эпителиальных прогениторов свидетельствовала избирательная экспрессия рецепторных маркеров pan-СК (общий маркер эпителиальных клеток), характерная в период с 14 по 24 день не менее чем для 87% (FITC-staining). При этом в остальной популяции ЭСК не более чем 11% клеточных элементов связывало антитела к цитокератину. Особенностью роста эпителиоподобных клеток в культуре явилось также отсутствие склонности к слиянию с другими производными стволовых клеток – даже при достижении полного монослоя в большинстве случаев крупные эпителиоподобные конгломераты были отделены практически по всему периметру тонкой демаркационной линией от 5 до 20 мкм.
Из представленных в таблице данных можно сделать вывод, что заявляемый пептид проявляет высокую активность по отношению к дифференцировке клеточных элементов в направлении эпителиальных прогениторов. Данное соединение может найти применение в медицине и ветеринарии в качестве средства с ранозаживляющим действием, стимулирующего процесс эпителизации. Нижеследующие чертежи составляют часть описания настоящего изобретения и включены для дополнительной демонстрации некоторых аспектов настоящего изобретения. Настоящее изобретение можно лучше понять путем обращения к одному или нескольким из этих чертежей в сочетании с подробным описанием представленных здесь конкретных вариантов осуществления настоящего изобретения. На фиг.1 представлена пространственная структура Г-КСФ [9]. На фиг.2 представлена пространственная структура белка Г-КСФ с идентифицированным функциональным сайтом (функциональный сайт выделен). На фиг.3 представлена пространственная структура комплекса Г-КСФ/рецептор [10]. На фиг.4 представлена пространственная структура комплекса Г-КСФ/рецептор с идентифицированным функциональным сайтом белка Г-КСФ (функциональный сайт выделен). Формулы заявляемых пептидов были выявлены по результатам компьютерного конструирования участков связывания гранулоцитарного колониестимулирующего фактора роста с рецепторами поверхности стволовых клеток. Компьютерное конструирование участков связывания Г-КСФ с его рецептором проводили с помощью программного комплекса, осуществляющего компьютерное моделирование пространственной структуры белковых молекул и дизайн низкомолекулярных соединений, ответственных за биологическую функцию белка. Далее использована оригинальная система прогноза, которая и позволила сгенерировать искомые последовательности Пример 2 In silico конструирование функционального сайта Г-КСФ на основе пространственной структуры белка Г-КСФ Для осуществления конструирования функционального сайта Г-КСФ использовалась компьютерная программа. Исходными данными для работы послужили первичные и пространственные структуры белков, импортированные из банка данных Protein Data Bank [8]. В базе данных банка проводили поиск пространственной структуры Г-КСФ. В результате для компьютерного конструирования отобрали пространственную структуру Г-КСФ [9] (фиг.1). Далее проводили компьютерное моделирование, которое позволило идентифицировать аминокислотные остатки белка Г-КСФ, принимающие участие во взаимодействии Г-КСФ с его рецептором и определяющим искомую биологическую активность (фиг.2). На основе полученных данных спрогнозировали формулы заявляемых пептидов. Пример 3 In silico конструирование функционального сайта Г-КСФ на основе пространственной структуры комплекса Г-КСФ/рецептор Для осуществления конструирования функционального сайта Г-КСФ использовалась компьютерная программа. Исходными данными для работы послужили первичные и пространственные структуры белков, импортированные из банка данных Protein Data Bank [8]. В базе данных банка проводили поиск пространственной структуры комплекса Г-КСФ/рецептор. В результате для компьютерного конструирования отобрали пространственную структуру комплекса Г-КСФ/рецептор [10] (фиг.3). Далее проводили компьютерное моделирование, которое позволило идентифицировать аминокислотные остатки белка Г-КСФ, принимающие участие во взаимодействии Г-КСФ с его рецептором (фиг.4). Полученные результаты совпадают с результатами Примера 2, что доказывает правильность конструирования функционального сайта Г-КСФ in silico. Источники информации Формула изобретения
Пептид, обладающий ростостимулирующей активностью гранулоцитарного колониестимулирующего фактора человека, общей формулы I
РИСУНКИ
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
, где где А представляет собой Boc – трет-бутилоксикарбонил или Ас – ацетил; X1 представляет собой Е, или D, или L, или Р, или S; Х2 представляет собой N, или Q, или А, или G; Х3 представляет собой G, или N, или V, или (
-А) – 
