Патент на изобретение №2320721

Published by on




РОССИЙСКАЯ ФЕДЕРАЦИЯ



ФЕДЕРАЛЬНАЯ СЛУЖБА
ПО ИНТЕЛЛЕКТУАЛЬНОЙ СОБСТВЕННОСТИ,
ПАТЕНТАМ И ТОВАРНЫМ ЗНАКАМ
(19) RU (11) 2320721 (13) C1
(51) МПК

C12N7/00 (2006.01)

(12) ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ К ПАТЕНТУ

Статус: по данным на 08.11.2010 – действует

(21), (22) Заявка: 2006124042/13, 06.07.2006

(24) Дата начала отсчета срока действия патента:

06.07.2006

(46) Опубликовано: 27.03.2008

(56) Список документов, цитированных в отчете о
поиске:
SU 1687609 А1 30.10.1991. SU 1581327 A1 30.07.1990. JP 61177985 09.08.1986.

Адрес для переписки:

105122, Москва, Сиреневый б-р, 3, корп.5, кв.140, А.А. Славохотовой

(72) Автор(ы):

Андреева Эмма Николаевна (RU),
Славохотова Анна Александровна (RU),
Извекова Людмила Ивановна (RU),
Елизарова Елена Васильевна (RU),
Шиян Александр Николаевич (RU),
Блинова Галина Петровна (RU),
Пухальский Виталий Анатольевич (RU)

(73) Патентообладатель(и):

НИИ общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН (RU)

(54) ШТАММ ВИРУСА ЗЕЛЕНОЙ КРАПЧАТОЙ МОЗАИКИ ОГУРЦА ВИРОГ-43М ДЛЯ ВАКЦИНАЦИИ РАСТЕНИЙ ОГУРЦА

(57) Реферат:

Изобретение относится к области биотехнологии, молекулярной генетики и представляет собой бессимптомный штамм вируса зеленой крапчатой мозаики огурца. Формой вирионов штамма является жесткая палочка размером 270×18 нм, и штамм относится к РНК-содержащим вирусам. Изобретение задерживает развитие заболевания крапчатой мозаики огурца и позволяет повысить урожай. 2 табл.

Изобретение относится к области биотехнологии, молекулярной генетики и представляет собой бессимптомный штамм вируса зеленой крапчатой мозаики огурца (ВЗКМО), который можно использовать для защиты растений огурца путем вакцинации растений.

Метод вакцинации растений давно разработан и успешно применяется в сельском хозяйстве. Эффект вакцинации слабопатогенным (ослабленным) штаммом заключается в том, что размножение такого предварительно введенного штамма вируса служит препятствием для размножения родственного патогенного вируса. При введении в растение слабопатогенного штамма вируса эти растения приобретают “иммунитет” к сильнопатогенным штаммам. В этом случае слабопатогенный штамм называют вакцинным. “Иммунитет” проявляется либо в удлинении срока появления симптомов заболевания, либо вообще в его отсутствие в течение всего времени вегетации, что приводит к уменьшению потерь и сохранению урожая (К.С.Сухов, Т.С.Подъяпольская, Извекова Л.И. Иммунизация растений против патогенного действия вирусов. М.: Наука, 1979).

Существуют вакцинные штаммы для защиты растений томата от вируса табачной мозаики томата: это ВТМ V-69 (Сухов К.С., Подъяпольская Т.С., Извекова Л.И. и др. Вакцинный штамм вируса табачной мозаики V-69: получение, свойства и практическое применение. Известия АН СССР. Серия биол. 1982, 1:113-125) и L11А (Nishiguchi М, Kikuchi S, Kiho Y, Ohno T, Meshi Т, Okada Y. Molecular basis of plant viral virulence; the complete nucleotide sequence of an attenuated strain of tobacco mosaic virus. Nucleic Acids Res. Aug 1985, 12; 13(15):5585-90). Ослабленные штаммы также используются для защиты перца от мягкой крапчатой мозаики перца (Ichiki TU, Nagaoka EN, Hagiwara K, Uchikawa K, Tsuda S, Omura Т.. Integration of mutations responsible for the attenuated phenotype of Pepper mild mottle virus strains results in a symptomless cross-protecting strain. Arch Virol. Oct; 150(10):2009-20. Epub 2005 Jun 22).

Нам не известны ослабленные штаммы ВЗКМО, используемые для защиты растений огурца. Выделение и применение таких штаммов может существенно повысить урожай, поскольку ВЗКМО в форме резкой зеленой мозаики поражает листья и плоды, вызывая значительные потери (до 40%). Вирус длительно сохраняется в семенах (1-2%) и затем быстро распространяется от растения к растению при ручной обработке, через почву и орудия труда.

Задачей данного изобретения являлось получение бессимптомного на растениях огурца вакцинного штамма ВЗКМО. Эта задача была решена с помощью штамма ВИРОГ-43М, который был получен в результате селекции патогенных штаммов ВЗКМО. Бессимптомные изоляты отбирались с помощью метода серодиагностики со специфической к ВЗКМО антисывороткой и препаративной очисткой. Штамм хранится в коллекции Института общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН.

Штамм ВИРОГ-43М имеет следующие морфологические характеристики: форма вирионов – жесткая палочка размером 270×18 нм. На растениях огурца и кабачка бессимптомен.

Штамм ВИРОГ-43М накапливается в листьях огурца в меньшей концентрации (0,5-0,75 мкг/г свежей ткани), чем патогенный ВЗКМО (1,5-2,0 мкг/г).

Штамм ВИРОГ-43А относится к РНК-содержащим вирусам и имеет следующую первичную структуру генома:

1 GTTTTAATTT TTATAATTAA ACCAACAACA ACAACAACAA CAAACATTTT AAAACAACAA
61 TGGCAAACAT TAATGAACAA ATCAACAATC AACGTGATGC TGCTGCTAGC GGGAGAAATA
121 ATCTCGTTAG TCAGCTAGCA TCAAAGAGGG TGTATGACGA GGCCGTTCGC TCGTTAGATC
181 ATCAAGATAG ACGCCCAAAA ATGAACTTTT CTCGTGTGGT CAGTACAGAG CACACCAGGC
241 TTATCACCGA TGCGTATCCG GAGTTTTCGA TTAGTTTCAC CGCTACCAAG AACTCAGTTC
301 ATTCCCTTGC GGGAAGTCTG AGGCTTCTTG AATTGGAGTA CATGATGATG CAGGTACCTT
361 ATGGTTCACC TTGCTTTGAT ATTGGCGGTA ATTACACGCA GCATTTATTT AAAGGCAGAT
421 CATATGTACA TTGCTGCAAT CCGTGCCTGG ATCTTAAAGA CGTTGCGAGG AATGTGATGT
481 ACAATGACAT AATTACGCAA CATGTGCAGA GGCATAAAGG ATCTGGTGGA TGCAGACCTC
541 TTCCGACTTT CCAGATAGAT GCTTTCAGGA GGTACGAAGA TTCGCCCGTT GCAGTCACCT
601 GTCCAGACGT TTTCCAAGAA TGTTCCTATG ATTTCGGGAG TGGCAGGGAT AATCATGCGG
661 TCTCATTGCA TTCGATTTAT GATATCCCTT ATTCTTCGAT CGGACCAGCT CTTCATAGGA
721 AAAACGTGAG AGTCTGTTAT GCAGCCTTTC ATTTCTCGGA GGCGTTGCTC TTAGGTTCGC
781 CCGTGGGTAA TTTAAATAGT ATAGGGGCTC AATTTAGGGT TGATGGTGAC GATGTGCATT
841 TTCTTTTTAG TGAGGAGTCA ACTTTGCATT ATACTCATAG TTTAGAGAAT ATTAAGTTAA
901 TCGTAATGCG TACTTATTTT CCTGCTGATG ATAGGTTCGT GTATATTAAG GAGTTTATGG
961 TTAAGCGTGT GGACACTTTC TTCTTTAGGT TGGTTAGGGC AGACACACAT ATGCTTCATA
1021 AATCTGTAGG GCACTATTCG AAGTCGAAAT CTGAGTATTT TGCGTTGAAC ACCCCCCCGA
1081 TTTTTCAAGA TAAGGCCACG TTTTCTGTGT GGTTTCCCGA AGCGAAACGG AAGGTGTTGA
1141 TACCTAAGTT CGAACTCTCG AGATTTCTTT CTGGAAATGT GAAAGTCTCT AGGATGCTTG
1201 TCGATGCTGA TTTTGTCCAT ACCATTATTA ATCACATTAG CACGTACGAT AACAAGGCTT
1261 TAGTGTGGAA GAATGTTCAG TCTTTTGTAG AATCTATACG CTCTAGGGTA ATTGTAAACG
1321 GAGTTTCCGT GAAATCTGAA TGGAACGTGC CGATCGATCA GCTTACTGAT ATCTCATTCT
1381 CGATATTCCT TCTCGTGAAG GTTAGAAAGG TGCAGATTGA GCTAATGTCT GATAAGGTCG
1441 TGATCGAGGC GAGGGGTTTG CTTCGGAGGT TCGCTGATAG TCTTAAATCC GCCGTAGAAG
1501 GACTAGGTGA CTGCGTCTAT GATGCTCTAG TTCAAACCGG TTGGTTTGAC ACCTCCAGCG
1561 ACGAACTGAA AGTATTGCTA CCTGAACCGT TTATGACCTT TTCAGATTAC CTCGAAGGGA
1621 TGTACGAGGC AGATGCGAAA ATTGAGAGAG AGAGTGTCTT TGAGCTGCTT GCTTCTGGAG
1681 ATGATCTGTT CAAGAAGATT GATGAGATAA GGAACAATTA CAGCGGAGTT GAATTTGATG
1741 TGGAGAAATT TCAAGAATTC TGTAAAGAAC TGAATGTTAA TCCCATGCTA ATTGGTCATG
1801 TGATCGAAGC TATTTTTTCG CAGAAGGCAG GGGTGACAGT CACGGGCCTA GGCACGCTCT
1861 CTCCTGAGAT GGGTGCTTCC GTTGCGTTGT CCAATAATTC TGTAGATACA TGTGATGATA
1921 TGGATGTAAC TGAGGATATG GAGGAAATAG TGTTGATGGC AGACAAGAAT CACTCTTACA
1981 TTTCTCCAGA AATGTCGAGA TGGGCTAATA TGAAATATGG CAATAATAAC GGGGCCTTAG
2041 TTGAATACAA GGTCGGAACC TCGATGACTT TACCTGCCAC CTGGGCAGAA AAGGGTAAGG
2101 CTGTCTTACC GTTGTCGGGA ATCTGTGTGA GAAAGCCCCA ATTTTCAAAG CTACTCGATG
2161 AGGAGGACGA CTTGAGGTTG TCAAACATGA ATTTCTTTAA GGTGAGTGAT CTAAAGTTAA
2221 AGAAGACTAT CACTCCAGTT GTTTATACTG GGACCATTCG AGAGAGGCAG ATGAAGAATT
2281 ATATCGATTA TCTATCGGCT TCTCTGGGTT CTACGCTTGG TAATCTTGAG AGAATTGTCA
2341 GGAGTGATTG GAATGGTACC GAGGAGAGCA TGCAAACTTT TGGATTGTAC GATTGTGAGA
2401 AGTGCAAGTG GTTGCTGTTA CCATCCGAGA AGAAACACGC CTGGGCTGTA GTCCTAGCGA
2461 GTGATGATAC CACTCGTATA ATCTTCCTGT CGTATGATGA ATCCGGTTCT CCTATAATTG
2521 ATAAGAAAAA TTGGAAGCGG TTCGCTGTCT GTTCTGATAC TAAAGTTTAT AGTGTGATTC
2581 GTAGTTTAGA AGTCTTAAAT AAGGAGGCCA TAGTCGATCC TGGGGTGCAT ATAACTTTAG
2641 TCGATGGGGT GCCGGGCTGT GGAAAAACTG CAGAAATTAT AGCGAGGGTC AATTGGAAAA
2701 CTGACCTTGT GTTGACTCCC GGAAGGGAAG CGGCTGCTAT GATCAGGCGA AGAGCCTGTG

2761 CCCTGCACAA 3TCACCTGTA GCTACTAGTG ATAACGTTAG GACTTTTGAC TCTTTCGTAA
2821 TGAATAAGAA 3GTTTTTAAA TTTGATGCCG TTTATGTAGA TGAGGGTCTT ATGGTCCATA
2881 CGGGGTTGCT CAACTTCGCG TTGAAGATTT CAGGTTGTAA AAAAGCCTTT GTCTTCGGTG
2941 ATGCTAAGCA AATTCCGTTT ATTAATAGGG TTATGAATTT TGATTATCCT AAGGAATTAA
3001 GAACTTTAAT AGTTGATAAC GTAGAGCGTA GGTATATTAC CCATAGGTGT CCTAGAGATG
3061 TCACTAGCTT TCTTAATACT ATTTATAAAG CTGCGGTTTC TACCACTAGT CCGGTTGTAC
3121 ATTCCGTGAA GGCAATAAAG GTTTCTGGGG CTGGTATTCT GAGGCCCGAG TTGACGAAGA
3181 TCAAAGGGAA GATCATAACG TTTACTCAGT CTGATAAACA ATCCTTGATC AAGAGTGGGT
3241 ACAATGATGT GAATACTGTG CATGAGATTC AAGGGGAGAC CTTTGAGGAA ACGGCGGTTG
3301 TACGTGCGAC ACCGACTCCA ATAGGTCTGA TTGCTCGAGA TTCACCACAC GTGTTGGTGG
3361 CTTTAACGCG GCATACCAAG GCAATGGTGT ATTATACCGT TGTGTTCGAT GCCGTTACAA
3421 GCATAATAGC AGATGTGGAA AAGGTCGATC AGTCAATTCT GACCATGTTT GCTACTACTG
3481 TGCCTACCAA ATAGCAATTA ACGCAGAACT CTCTGTATGT TCACCGCAAT ATTTTCCTCC
3541 CTGTCACTAA GACAGGGTTT TATACGGATA TGCAGGAGTT CTATGATAGG TGCCTTCCAG
3601 GGAATTCCTT TGTTTTGAAC GATTTCGATG CCGTCACCAT GCGGTTGAGG GATAACGAAT
3661 TTAATTTGCA ACCTTGTAGA TTAACTTTAA GTAATTTAGA TCCGGTGCCG GCTTTGATCA
3721 AGAGTGAGGC AAAAGATTTT CTGGTTCCCG TATTGCGAAC GGCTTGCGAA AGGCCACGTA
3781 TTCCGGGTCT TCTCGAAAAT CTTGTTGCTA TGATAAAGAG GAATATGAAT ACTCCTGATT
3841 TGGCTGGAAC CGTGGACATA ACTAACATGT CTATTTCTAT AGTAGATAAT TTCTTTTCTT
3901 CCTTTGTTAG GGACGAGGTT CTACTTGATC ATTTAGATTG CGTTAGAGCT AGTTCTATGC
3961 AGAGTTTTTC TGATTGGTTT TCTTGTCAGC CAACCTCGGC GGTTGGCCAG TTAGCTAATT
4021 TTAATTTCAT AGATTTACCT GCCTTTGATA CATATATGCA TATGATTAAG AGGCAGCCTA
4081 AGAGTCGGTT AGATACTTCA ATTCAGTCCG AATATCCGGC CTTGCAAACT ATTGTATATC
4141 ATCTGAAGGT GGTAAACGCA GTTTTCGGGC CGGTTTTTAA GTATCTGACT ACTAAGTTTC
4201 TTAGCATGGT AGATAATTCT AAGTTTTTCT TTTATACTAG AAAAAAGCCA GAGGATCTGC
4261 AGGAGTTTTT CTCGGATCTT TCTTCCCATT CTGATTATGA AATTCTTGAG CTCGATGTTT
4321 CTAAATATGA TAAGTCGCAG TCCGATTTCC ATTTCTCCAT CGAGATGGCA ATTTGGGAAA
4381 GGCTAGGACT AGATGATATT TTAGCTTGGA TGTGGTCCAT GGGTCATAAG AGAACTATAC
4441 TGCAAGACTT CCAAGCTGGA ATAAAGACGC TCATTTATTA TCAAAGGAAG TCTGGTGATG
4501 TAACTACTTT TATAGGTAAT ACTTTTATTA TTGCAGCGTG CGTAGCTAGT ATGTTACCGT
4561 TAGATAAGTG TTTTAAGGCT AGTTTTTGTG GTGATGATTC GTTAATCTAC CTTCCTAAGG
4621 GTTTGGAGTA TCCTGATATT CAGGCTACCG CCAATTTGGT TTGGAATTTT GAGGCGAAAC
4681 TTTTCCGGAA GAAGTATGGT TACTTCTGCG GGAAATATAT CATTCATCAC GCCAACGGCT
4741 GTATTGTTTA CCCTGACCCT TTAAAGTTAA TTAGTAAATT AGGTAGTAAG AGTCTTGTCG
4801 GGTATGAGCA TGTCGAGGAG TTTCGTATAT CTCTCCTTGA TGTCGCTCAT AGTTTGTTTA
4861 ATGGTGCTTA TTTCCATTTG CTCGACGATG CAATCCACGA GTTGTTTCCT AATGCTGGGG
4921 GTTGCAGTTT TGTAATAAAT TGTTTGTGTA AGTACTTGAG TGATAAGCGC CTTTTCCGTA
4981 GTCTTTATAT AGATGTCTCT AAGTAAGGTG TCGGTCGAGA ACTCGTTGAA ACCTGAGAAA
5041 TTCGTTAAAA TTTCCTGGGT TGACAAGTTG CTCCCTAATT ACTTTTCTAT TCTTAAGTAC
5101 CTATCTATAA CTGACTTTAG TGTAGTTAAA GCTCAGAGTT ATGAATCCCT CGTGCCTGTC
5161 AAGTTGTTGC GTGGTGTTGA TCTTACAAAA CACCTTTATG TCACACTGTT GGGCGTTGTG
5221 GTTTCTGGTG TATGGAACGT ACCGGAATCC TGTAGGGGTG GTGCTACTGT TGCTTTGGTT
5281 GACACAAGGA TGCATTCTGT TGCAGAAGGA ACTATATGCA AATTTTCAGC TCCCGCCACC
5341 GTCCGCGAAT TCTCTGTTAG GTTCATCCCT AACTATTCTG TCGTGGCTGC GGATGCCCTT
5401 CGCGATCCTT GGTCTTTATT TGTAAGGCTC TCTAACGTAG GTATTAAGGA TGGTTTTCAT
5461 CCATTAACTT TAGAGGTCGC CTGTTTAGTT GCCACTACTA ATTCTATTAT AAAAAAGGGG
5521 CTTAGAGCTT CTGTAGTTGA GTCTGTTGTC TCTTCCGATC AGTCGATTGT TCTAGATTCT

5581 TTATCTGAGA AAGTTGAGCC TTTCTTCGAT AAAGTCCCTA TTTCAGCGGC CGTAATGGCG
5641 AGAGACCCCA GTTATAGGTC TAGGTCGCAG TCTGTCGTTG GTCGTGGTAA GCGGCATTCT
5701 АААССТССАА ATCGGAGGTC GGACTCTGCT TCTGAAGAGT CCAGTTCTGT ATCTTTCGAA
5761 GATGGCTTAC AATCCGATCA CGCCTAGCAA ACTTATTGCG TTTAGTGCTT CCTATGTTCC
5821 CGTTAGAACT ТТАСТТААТТ TTCTAGTGGC GTCGCAAGGT ACTGCTTTCC AAACTCAGGC
5881 AGGAAGAGAT TCCTTCCGTG AGTCTTTGTC TGCGTTACCT TCATCTGTTG AAGATATTAA
5941 TTCTAGGTTC CCGAGTGCGG GTTTTTACGC ТТТССТСААС GGTCCTGTGT TGAGGCCTAT
6001 CTTCGTTTCG CTTCTTAGCT CTACGGATAC GCGTAATAGG GTCATTGAGG TTGTAGATCC
6061 TAGCAATCCG ACGACTGCTG AGTCGCTTAA CGCAGTCAAG CGTACTGACG ATGCGTCTAC
6121 AGCCGCTAGG GCTGAGATAG ATAATTTGAT AGAGTCTATC TCTAAGGGGT TTGATGTTTA
6181 TGACAGGGCT TCTTTTGAAG CCGCGTTTTC GGTAGTCTGG TCAGAGGCTA ССАССТСТАА
6241 GGCTTAGCCT TGAGGGTCTT CTGACGGTGG TGCACACCAT AGTGCATAGT GCTTTCCCGT
6301 ТСАСТТТААТ CGAACGGTTT GCTCATTGGT TTGCGAAAAC CTCTCGCGTG TGACGCTGAA
6361 GTTTTTATGG GCAGTAATTC TGCAAGGGGT TCGAATCCCC CCTTTCCCCG GGTAGGGGCC
6421 СА

Первичную структуру вирусной РНК ВИРОГ-43М определяли с помощью автоматического секвенирования фрагментов кДНК, полученных методом праймер-опосредованной «прогулки по геному».

Для получения вакцины штамм сначала накапливают в растениях огурца в течение трех недель после заражения при температуре 18-25°С. Затем проводят выделение ослабленного штамма из листьев огурца и его очистку по методике. Такой препарат может храниться в ампулах в течение 1,5-3 лет при +5°С.

Вакцинация в производственных условиях осуществляется путем опрыскивания 10-12-дневных сеянцев огурца в стадии 1-2 развернутых настоящих листьев водным раствором вакцинного препарата с помощью бытовых пылесосов и прилагаемых к ним распылителей не менее чем за 3-4 дня до высадки в грунт.

Пример 1. Эксперименты по испытанию свойств штамма ВИРОГ-43М проводили в условиях лабораторных теплиц в трехкратной повторности по 100 растений в каждом опыте (таблица 1).

Таблица 1
Длительность сохранения бессимптомности ВИРОГ-43М в условиях лабораторного опыта и интерференция с патогенным штаммом ВЗКМО
Варианты опыта* Число бессимптомных растений в % Число растений с симптомами резкой мозаики, %
Время испытания после заражения ВИРОГ-43М Время испытания (месяцы) Время испытания (месяцы)
1,5 2,0 2,5 3,0 1,5 2,0 2,5 3,0
ВИРОГ-43М 100 100 98,0 98,0 0 0 2,0 2,0
ВИРОГ-43М + ВЗКМО (через 2 недели после заражения ВИРОГ-43М) 98,0 95,0 93,0 85,0 2,0 5,0 7,0 15,0
ВЗКМО 0 0 0 0 100 100 100 100
* Для заражения использовали препараты вирусов в концентрации 0,5 мкг/мл

В условиях лабораторного эксперимента растения огурца, зараженные ВИРОГ-43М, остаются бессимптомными в течение трех месяцев испытаний (табл.1), что свидетельствует о высокой генетической стабильности штамма ВИРОГ-43М.

Штамм ВИРОГ-43М обладает способностью к интерференции с патогенными штаммами ВЗКМО, так как обладает вакцинными свойствами, которые проявляются в длительном сохранении бессимптомности у вакцинированных растений после заражения их резким мозаичным штаммом ВЗКМО (табл.1).

Пример 2. Производственные испытания проводили в ЗАО агрокомбината «Московский» на площади по 1 га вакцинированных и невакцинированных посадок.

Таблица 2
Подавление развития мозаичного заболевания ВЗКМО на посадках огурца, обработанных ВИРОГ-43М
Варианты опыта и гибриды огурца Сроки наблюдений через 1 месяц после обработки ВИРОГ-43М и % резкой мозаики ВЗКМО в летнем обороте
1-й месяц 2-й месяц 3-й месяц 4-й месяц
ВИРОГ-43М 0,5 мг/мл; F1 Кураж 0,1 2,0 3,2 7,5
Без обработки 2,0 12,2 34,1 51,5
ВИРОГ-43М,0,5 мг/мл; F1 Пассалимо 5,4 11,0 19,3 34,2
Без обработки 3,7 25,0 48,0 82,9

Исходя из приведенных в таблице данных, можно сделать вывод, что штамм ВИРОГ-43М обладает бессимптомностью, генетической стабильностью и способностью к интерференции с патогенными штаммами ВЗКМО. Следовательно, данный штамм может быть использован в практике защиты растений огурца от патогенного ВЗКМО, где на фоне резкой мозаики можно ожидать прибавки урожая не менее 25-30%.

Формула изобретения

Штамм вируса зеленой крапчатой мозаики огурца ВИРОГ-43М для вакцинации растений огурца.

Categories: BD_2320000-2320999